背景說明
混合物樣品中含有不同分子量、不同溶解度和不同修飾的完整蛋白質,因此在進行蛋白全質譜鑒定時,樣品經酶切消化成多肽片段,使用鳥槍法蛋白質組學對樣品進行鑒定。鳥槍法蛋白質組學的原理是先將蛋白質樣品消化成肽段,然后將肽段通過高效液相色譜(HPLC)法進行分離。分離后的肽段直接進入質譜儀進行分析。質譜分析包括了兩個過程,一級質譜(MS1)及二級質譜(MS2)。一級質譜獲取高效液相色譜MS1中洗脫的肽的質量-電荷比(m/z)和肽的強度(intensity);二級質譜通過對肽段氨基酸序列進行確定,MS2選擇單個肽段對其進行碎裂從而得到該肽段的譜圖數據。檢索軟件根據二級質譜信息與相應的數據庫比對,結合匹配度打分及錯配過濾,可得到肽段的確切序列,進而拼接出各蛋白的完整序列,從而實現對蛋白的鑒定。
圖 蛋白質組全譜鑒定流程圖
服務流程
服務內容及說明
適用場景
蛋白全質譜鑒定可對復雜樣本進行蛋白種類分析,適用于生物組織、血液和微生物等復雜樣品中蛋白質組分的分析,特別是適用于在某一特定生理狀態下研究蛋白質的整體規律或特有蛋白。
實驗周期
自送樣起45個工作日。
客戶下單及項目信息填寫
在我司官網http://plant.biorun.com/進行注冊或登錄,請客戶按照頁面提示填寫項目名稱、選擇項目類型、填寫個人信息及聯系方式,提交項目所需要的具體信息,包括:
1、樣品來源、含量、狀態及其他基本信息;
2、盡可能豐富的相關資料、文獻。
實驗信息
實驗過程中客戶可以隨時登入管理系統查看項目實時進展情況。實驗結題時系統會通過短信自動通知客戶,并發送實驗報告查看網址。實驗結題后,實驗報告、檢測結果可在線查看或打印,并永久保留。
實驗交付內容
1、實驗報告一份,含具體實驗流程及蛋白質組鑒定及定量結果(生物信息學分析);
2、生物信息學分析內容包括:
多肽、蛋白質鑒定;
鑒定結果特征分析:肽段程度分布、蛋白鑒定覆蓋度、unique肽段數分布等。